除了第五代iPod產品外，蘋果在媒體大會上還正式發布了iPhone OS 3.1固件更新，版本號3.1.1.iPhone，OS 3.0用戶想升級需要支付4.95美元。
iPhone OS 3.1的升級內容包括:
• 支持iTunes 9新功能.
• 直接在手機/掌機中兌換iTunes禮品卡、禮品代碼和認證碼.
• 在App Store和iTunes Store中顯示帳戶余額.
• 將郵件和彩信中的視頻保存到Camera Roll.
• iPhone 3GS拍攝視頻剪輯后支持另存為新片段.
• 可通過MobileMe輸入密碼遠程鎖定手機.
• 可使用藍牙耳機語音控制iPhone 3GS.
• 在撥號鍵盤中粘貼電話號碼.
• 在iPhone 3GS上可以設置使用Home鍵開啟殘疾人輔助功能.
• Safari瀏覽器加入防釣魚警告功能.
• 改進Exchange日歷同步和邀請函處理功能.
• 修正導致程序圖標顯示不正常的問題.
（第三媒體 2009-09-10）