寶德服務器: 應用于中國疾病預防！寶德HPC集群系統

寶德HPC大型機群系統在生物醫療行業有著良好的口碑，寶德以其先進的技術，穩定的表現，實惠的性價比贏得一批又一批用戶。寶德科技在HPC領域一直與Intel在技術的后端有深層次的合作，2004年3月建設了基于Intel IA架構為計算節點的寶德HPC實驗室，為學校及學術單位的科研工作提供先進、穩定、有效、可靠、經濟的計算工具平臺，測試和演示的環境。

傳染病預防控制所是中國疾病預防控制中心領導下的國家級傳染病預防控制專業機構，是全國傳染病預防控制業務技術指導中心。長期以來，傳染病所缺少一套可用于高性能計算的集群系統，使其在基因分析等業務運行方面受到較大限制；與同行業的院所相比有一定差距。

因此傳染病所決定構建一套生物信息計算集群，為其下屬各實驗室提供一個統一計算平臺，提高計算機應用和管理水平。

用戶需求：
傳染病預防控制所需要該集群系統能夠承擔大規模運算任務，包括序列的多重比對、系統發育學研究、細菌全基因組序列分析、生物信息學綜合分析等。

方案描述：
寶德科技根據客戶要求，推薦基于四核至強®服務器的POWER Cluster8000 HPC系統解決方案，寶德POWER Cluster8000 HPC系統分層次設計，按照高性能計算生態系統部署，自上而下，包括HPC并行應用程序、中間件集群管理、通信庫以及各類軟件優化工具、操作系統、計算節點和主控節點的硬件平臺、互聯網絡系統等。方案具有開放性、可擴展、性價比高的特點，滿足傳染病所的的應用需求。

依照初步草案，寶德科技與華大基因、照生軟件與客戶進行了多次交流，向客戶詳細介紹了方案中的種種優點，突出了寶德產品的優勢，獲得了客戶的贊同。在這個過程中，華大基因項目的成功有很大幫助，因為有華大基因項目的經驗，流行病所對寶德科技的能力表示認可。

其中管理節點服務器采用寶德PR2700服務器，存儲節點采用PR3015S，計算節點采用寶德PR1760T高密度計算服務器。寶德“雙子星”系列1U服務器PR1760T，是一款高計算密度的機架式服務器，主要特點是節省空間，倍增集成能力、將原先兩臺1U機架式產品，集成到1U空間內；相當于兩臺服務器集成，可以獨立控制和管理、運行。整機提供4個集成網卡。并提供網卡冗余、散熱風扇冗余能力，保證系統真正高可用。提升電源使用效率達到90％以上，滿足系統高可用。極強性價比、領先的性能/U水平，高集成度設計，性能價格比相比普通機架式服務器提升一倍，同時在有限的1U空間內提供業界最強大的性能表現；獨立控制，高穩定、高可用。

技術亮點：

寶德服務器均基于Intel IA架構，配合新一代四核處理器，前端總線（FSB）最高可達1333MHz，采用S5000P芯片組，雙獨立總線，數據帶寬最高可達21GB/s。同時，融合Hyper Threading技術，最大限度利用處理器處理進程。

   寶德IA服務器具有以下幾個鮮明的特點：
   ◎可伸縮性（Scalability），當服務的負載增長時，系統可被擴展來滿足需求，且不降低服務質量。
   ◎高可用性（Availability），盡管部分硬件和軟件會發生故障，整個系統的服務必須是每天24小時每星期7天可用的。
   ◎可管理性（Manageability），整個系統可能在物理上很大，但應該容易管理。
   ◎價格合理(Cost-effectiveness)，整個系統實現是經濟的、易支付的。

系統拓撲：

系統配置：

商業價值：
本次采用INTEL架構服務器搭建的管理信息系統，充分體現了領先一代的Intel IA平臺從研發到制造工藝，Intel積累了近二十年的技術結晶，厚積薄發，為高性能計算研究領域提供最好的計算平臺。疾病所計算集群項目與華大基因項目類似，成功實施此項目將進一步擴大公司在生物、基因領域的影響。

經驗收獲：
疾病所在全國還有11家類似的研究機構，在不遠的將來很多都需要使用一套類似的計算信息系統；做好這個項目有著標志性的意義。其他所可以對集群使用有一個直觀印象，參照流行病所的使用經驗構建自己的計算集群。

（新聞稿 2008－06－19）