金秋十月的深圳第十屆中國高新技術成果交易會上,寶德科技因其生產的HPC高性能計算機揭開國寶大熊貓基因秘密倍受矚目。深圳華大基因研究院十月宣布,中華大熊貓“晶晶”基因組框架圖繪制完成。這也是中國科學家繼去年完成第一個黃種人基因組圖譜后,在生命科學領域又一里程碑式的貢獻。
早在今年3月份,由中國科學家發起,加拿大、英國、美國、丹麥等國家的科學家聯合參與的國際大熊貓基因組研究項目啟動。大熊貓基因組包含約2萬~3萬個基因,這個項目的作用在于能夠揭示大熊貓極強的環境適應能力及其進化的分子機理,而且利于大熊貓疫病控制,以保護瀕危品種,同時也可為大熊貓的人工繁殖提供科學依據。曾經作為2008北京奧運會吉祥物的原型之一的大熊貓晶晶,成為國際大熊貓基因組研究項目的首個測序對象,華大基因研究院的科學家,利用寶德科技提供的高性能計算機順序地完成了大熊貓基因的測序任務。
負責主持這一項目的王俊博士說:“大熊貓共有21對染色體,基因組大小與人類相似約為30億個堿基對,包含2-3萬個基因。我們的研究工作量巨大,如果將大熊貓基因組序列寫成一本書,其厚度相當于384米高的大廈。”據介紹,華大自主研制的全基因組組裝軟件及自主搭建的高性能計算平臺在其中發揮了關鍵性的作用。這一基因組序列圖的繪制,采用了新的測序技術,使得測序的速度大大提高,成本大大降低。這是全世界第一個用這項新技術完成的標志性的大型基因組序列圖。這一成果也在一定程度上體現了中國的國家競爭力和深圳市的城市創新能力。
寶德參與大熊貓基因研究的是POWER Cluster8000 HPC計算機系統,寶德POWER Cluster8000 HPC系統采用分層設計,按照高性能計算生態系統部署,自上而下,包括HPC并行應用程序、中間件集群管理、通信庫以及各類軟件優化工具、操作系統、計算節點和主控節點的硬件平臺、互聯網絡系統等。方案具有開放性、可擴展、性價比高的特點,滿足基因研究的應用需求。
寶德HPC計算機系統包括標準42U電信機柜,管理節點服務器、存儲節點服務器、計算節點服務器,操作系統及應用軟件等。其中管理節點服務器采用寶德PR2700服務器,存儲節點采用PR3015S,計算節點采用寶德PR1700H高密度節能服務器。寶德“雙子星”系列1U服務器PR1700H,是一款高計算密度的機架式服務器,采用四核及45納米芯片技術,節省空間,倍增集成能力、將原先兩臺1U機架式產品,集成到1U空間內;相當于兩臺服務器集成,可以獨立控制和管理運行。
寶德作為中國最主要的服務器廠商,時刻站在服務器技術的前沿,在HPC高性能計算領域有著獨特的優勢。目前寶德又在深圳觀瀾工業園區建成亞洲最大的服務器研發制造基地,同時寶德還是全球ISA解決方案聯盟的唯一中國成員,其安騰服務器銷量連續5年獲得國內第一名,亞州排名第二;其機架服務器也連續7年銷量第一,成為名副其實的“機架王”。同時是英特爾在中國最重要的戰略合作伙伴之一,英特爾在深圳的服務器研發、生產將主要依托寶德研發生產基地。
(新聞稿 2008-10-31)